Sekolah Pascasarjana Universitas Djuanda Bogor (Pascasarjana UNIDA) didirikan pada Tahun 2002 dengan Keputusan Badan Pengurus Yayasan Pusat Studi dan Pengembangan Islam, Nomor : 001/SK/BP-YPSPI/II/2002 tentang Penyelenggaraan Program Pasca Sarjana Universitas Djuanda, tanggal 28 Februari 2002.

Di tahun yang sama dibentuklah Program Magister pertama yang dikelola oleh Pascasarjana UNIDA yaitu Program Magister Ilmu Hukum melalui Surat Keputusan Rektor Universitas Djuanda Nomor : 264/2002 tentang Pembentukan Program Magister Ilmu Hukum Pada Program Pascasarjana Universitas Djuanda, tanggal 18 September 2002. Di Tahun 2015, Pascasarjana Unida telah menambah 2 (dua) Program Magister baru antara lain : Magister Administrasi Publik dan Magister Teknologi Pangan Halal yang diharapkan mampu memenuhi kebutuhan masyarakat di bidang pendidikan sehingga mampu meningkatkan qualifikasi dan skill para lulusannya.

Program Studi S2

• Magister Hukum
• Magister Teknologi Pangan
• Magister Administrasi Publik

Jadwal Pendaftaran Universitas Djuanda (UNIDA) Tahun Akademik 2023/2024

• Gelombang Perdana: 1 November 2022 – 9 Januari 2023
• Gelombang I: 10 Januari – 3 April 2023
• Gelombang II: 4 April – 5 Juni 2023
• Gelombang III: 6 Juni – 7 Agustus 2023
• Gelombang IV: 8 Agustus – 9 September 2023